Nació Juan Manuel en la ciudad de Antequera el veinticinco de noviembre de 1680, y era hijo de Juan Urbina y Narváez (1652), y de María Ana de Lomelín y Negro (1652), naturales ambos de Antequera.
Inició
su carrera militar cuando ingresó en el regimiento de Reales Guardias de
infantería española, en la que tuvo una meteórica carrera, pues ascendió a
alférez el primero de noviembre de 1706, a alférez de granaderos el veintiocho
de noviembre de 1708, a segundo teniente el primero de septiembre de 1710, a
primer teniente el quince de mayo de 1711, a capitán el veintiséis de enero de
1719.
En el ínterin, fue promovido al empleo de teniente general el diecisiete de diciembre de 1754.
A su regreso a la Península, fue nombrado el diez de enero de 1762 comandante general de la Costa de Granada y el catorce de enero de 1765 capitán general propietario de esa, cargo que mantuvo hasta su fallecimiento, el cual tuvo lugar en la localidad abulense de Arévalo, el catorce de enero de 1774.
Contrajo matrimonio el año de 1728 en la ciudad de Badajoz, con Josefa Guazo de Calderón y de la Torre (c. 1710-1751), teniendo el matrimonio dos hijos: Bartolomé, caballero de Santiago desde 1762, y María de las Nieves.